问题如下：
链接表的额外特性尚未激活。要查出原因，请点击此处。
使用配置文件中定义的控制用户连接失败。
服务器上运行了 Suhosin。请先查看文档中是否有类似的情况。
由于我是使用的apt-get安装的phpmyadmin，检查配置文件发现，/usr/share/phpmyadmin下的config.inc.php实际上映射的是/etc/phpmyadmin/config.inc.php。
打开/etc/phpmyadmin/config.inc.php，根据错误提示，找到控制用户的代码：
$cfg['Servers'][$i]['controluser'] =
$cfg['Servers'][$i]['controlpass'] =
删掉等号后面的东西，改成：
$cfg['Servers'][$i]['controluser'] = ‘root’;
$cfg['Servers'][$i]['controlpass'] = ’123456′;
123456为你root的密码，保存，刷新phpmyadmin页面 使用配置文件中定义的控制用户连接失败。 问题解决。
网络下下载一个对应你phpmyadmin版本的安装包，我下载的是：phpMyAdmin-3.2.2-all-languages.zip，解压scripts/create_tables.sql文件，登录phpmyadmin，新建一个名叫phpmyadmin的数据库，导入create_tables.sql文件。
然后修改/etc/phpmyadmin/config.inc.php，将：
$cfg['Servers'][$i]['pmadb'] = ‘phpmyadmin’;
$cfg['Servers'][$i]['bookmarktable'] = ‘pma_bookmark’;
$cfg['Servers'][$i]['relation'] = ‘pma_relation’;
$cfg['Servers'][$i]['table_info'] = ‘pma_table_info’;
$cfg['Servers'][$i]['table_coords'] = ‘pma_table_coords’;
$cfg['Servers'][$i]['pdf_pages'] = ‘pma_pdf_pages’;
$cfg['Servers'][$i]['column_info'] = ‘pma_column_info’;
$cfg['Servers'][$i]['history'] = ‘pma_history’;
$cfg['Servers'][$i]['designer_coords'] = ‘pma_designer_coords’;
前的注释去掉，不过，我的本身就这样，我没做任何修改，登出phpmyadmin，再登录，如何？链接表的额外特性尚未激活。要查出原因，请点击此处。 问题解决！
至于 服务器上运行了 Suhosin。请先查看文档中是否有类似的情况。 问题，suhosin本身是加强PHP安全性的脚本，不影响mysql使用，无须理会。